Руководитель — А.А. Астахова (СУНЦ МГУ)
Глиомы –гетерогенная группа первичных злокачественных опухолей головного и спинного мозга с низкой выживаемостью без эффективных терапий. Аннексин А1 (ANXA1) – кальций-связывающий белок, вовлеченный в различные процессы, связанные с пролиферацией, ростом, иммунным ответом, и др. Цель нашей работы — охарактеризовать участие ANXA1 в молекулярных механизмах, вовлеченных в биологические процессы глиом. Использован массив данных о полногеномной экспрессии GSE16011 по 284 образцам, данные о принадлежности образцов к классам, данные о составе модулей коэкспрессирующихся генов из ранних исследований. Анализ дифференциальной экспрессии ANXA1 в разных классах глиом проведен в приложении MeV(TM4) по критерию Манна-Уитни (значение p принимали равным менее 0.05).Анализ коэкспрессии между генами проведен в средеR:вычисляли коэффициент ранговой корреляции Спирмена между профилями экспрессии генов (значимым считали коэффициент, равный или превышающий 0,7). Данные о связи между генами и клетками иммунной системы брали из ресурса (http://humbio.ru/). Для выявления биологических функций генов использовали биоинформатический ресурс DAVID.
Получено, что экспрессия ANXA1 усиливается в глиомах и отличает молекулярные классы с благоприятным прогнозом от классов с наименьшей продолжительностью жизни. ANXA1 связан с сигнальным путем NF-кB и коэкспрессируется с генами, продукты которых вовлечены в формирование межклеточных контактов, связывание кальция, организацию внеклеточного матрикса, активность лизосом, сигнальный путь эпидермального фактора роста и процессы врожденного иммунитета. Изменение экспрессии ANXA1 положительно коррелирует с изменением экспрессии CD58, CD164, CD63, что вероятно указывает на роль T-лимфоцитов, моноцитов и макрофагов соответственно как одних из источников экспрессии этого гена.