Научный руководитель: к.х.н. Хайбрахманова Диляра Раисовна, младший научный сотрудник Химического института им. А.М. Бутлерова КФУ.
Цель исследования: синтезировать азопроизводное сульфаниламида и салициловой кислоты (рис. 1) и изучить его физико-химические свойства.
Рис. 1. Азопроизводное сульфаниламида и салициловой кислоты
Задачи исследования:
- Проведение синтеза
- Изучение физико-химические свойств полученных веществ: константы кислотности Ka и коэффициента распределения logD
- Поиск белка-мишени, проведение докинга
- Поиск соотношений структура-свойство: IC50, Ki и MM-GBSA
Сульфаниламид обладает антибактериальными свойствами и используется как антибиотик. В свою очередь, его производные сохраняют эти свойства, но могут действовать на разные системы органов человека. Модификация уже существующих структур является одним из основных методов создания новых лекарственных препаратов. Кроме того, новые антибиотики могут быть более эффективными и безопасными, чем уже существующие. Изучение же физико-химических свойств позволяет предсказать характеристики вещества и выбрать наиболее подходящую под требования молекулу.
Исследование:
- Синтез молекулы по реакции азосочетания (рис. 2)
Рис. 2. Схема синтеза
- Снятие спектров поглощения вещества при разных рН с помощью спектрофотомерии и нахождение Ka
- Измерение коэффицента распределения вещества между органической и неорганической фазой
- Создание модели машинного обучения в программе Knime, получение LSER-модели для IC50, Ki
- Проведение докинга в программе Schrodinger, расчёт MM-GBSA
Результаты: выход синтеза – 46,2%
pKa = 11,15
lgD = -1,689
Предсказанные величины для разных белков:
pIC50 (IC₅₀ является количественным индикатором, который показывает, сколько нужно лиганда—ингибитора для ингибирования биологического процесса на 50 %.)
COX-1: 5,12
COX-2: 4,69
pKi (константа ингибирования)
COX-2: 8,00
DHPS: 4,761
MM-GBSA (свободная энергия связывания белка и лиганда)
COX-1: 6,99
COX-2: -20,96
DHPS: -20,73
Выводы: Получены новые данные для молекулы, которые могут быть использованы при отборе в качестве лекарственного препарата.