Руководитель — О.В. Колясников (СУНЦ МГУ)

Калиниченко Андрей3

Цель работы: поиск консервативных мотивов связывания антигена антителами с помощью водородных связей.

С помощью программ PyMOLViewer, BLASTb изучались последовательности и пространственные структуры комплексов антител с их антигенами (источник структур — SAbDab), а также проводилось сравнение структур, для выявления повторяющихся позиций аминокислот (конкретный тип и номер аминокислот в белковой цепи), взаимодействующих с антигеном с помощью водородных связей.

В результате был найден мотив, встречающийся у 70% антител. Это совокупность двух позиций: одна в тяжёлой – TYR/THR/GLYH33, и вторая в лёгкой –SER/ARGL91.