DSC02877  DSC02873   DSC02876

Научный руководитель — Свистунова Д.М.

Некоторые классы эукариотических белков, взаимодействующих с нуклеиновыми кислотами, имеют в своем составе особую последовательность – GAR-домен. Это участок белка, богатый остатками аргинина и глицина, состоящий из большого числа повторяющихся мотивов RG и RGG. Несмотря на тот факт, что описано большое число эукариотических белков с подобным доменом, среди прокариот данный домен встречается крайне редко. До сих пор остается неясным вопрос, каким образом в ходе эволюции многие эукариотические белки приобрели данную последовательность. Целью данной работы было найти примеры изменений, которые потерпел GAR-домен белков в ходе эволюционных изменений, связанных с появлением и усложнением эукариот

Работа проводилась методом анализа базы данных белковых последовательностей.

Зачастую гомологичные белки про- и эукариот отличаются в основном именно наличием или отсутствием GAR-домена. Среди немногочисленных обнаруженных нами прокариотических белков, содержащих RG-домен, особое внимание привлекли к себе DEAD box РНК хеликазы. Эти белки характеризуются наличием в их центральном домене двенадцати консервативных мотивов, перемежающихся менее консервативными участками. Помимо корового домена, на C-конце бактериальных РНК хеликаз также присутствует GAR-домен. В ходе эволюции консервативные мотивы функциональной части белка практически не подверглись изменениям, тогда как RG-богатый домен изменил свое расположение в белке. Характерное для прокариот расположение GAR-домена на C-конце молекулы белка наблюдается лишь у хлоропластов и отдельных представителей домена эукариот. У представителей царств грибов, растений и животных данный домен преимущественно располагается на N-конце белка или на обоих концах молекулы. Изменениям подвергся и аминокислотный состав RG-домена – в некоторых белках эукариот домен представлен практически исключительно остатками глицина. Можно предположить, что такие существенные изменения связаны со сменой функциональности данного домена.

презентация   текст