Руководитель: Владимир Константинович Аржаник (ФББ МГУ)

Координатор от СУНЦ МГУ: О.В.Колясников

Беляева Юлия, Смирнова Александра 2 Беляева Юлия, Смирнова Александра 3

презентация   Беляева Смирнова

текст

Цель работы: выявить закономерности связывания малых положительно-заряженных антигенов с антителами.

Задачи:

  • Выбрать группы антигенов, необходимых для изучения;
  • Описать взаимодействие с аминокислотами антитела, систематизировать данные;
  • Выявить закономерности связывания антигенов данного типа с антителами.

Методы:

  • Поиск по базе данных SAbDab
  • Визуализация биомолекул
  • Корреляционный анализ

Результаты:
•          «+»-заряженные группы малых лигандов взаимодействуют с антителом через «-»– заряженные аминокислоты (глутаминовая и аспарагиновая кислоты)

  • Позиции, связывающие заряженные группы антигена, расположены как на гипервариабельных, так и на каркасных участках
  • Двойной пи-стэкинг, по-видимому, является более выгодным способом связывания антигена с антителом, чем электростатическое взаимодействие
  • При наличии в антигене с «+»-заряженной группой «-»-заряженных групп, в формировании электростатического взаимодействия «+»-заряженная группа может не участвовать, если участвует «-» — заряженная.

По материалам работы подготовлены выступления на конференциях:

«XVI Колмогоровские чтения» (май 2016, Москва): «Взаимодействие антител с  положительно заряженными малыми антигенами»